СУ "Св. Климент Охридски"

Научноизследователски проекти

Skip Navigation Links
 

Търсене

Новини

Вход в системата

 

 





>>Регистрация
>>Забравена парола

Ръководство


Сравнителен анализ на ефективността на нови антибактериални агенти базирани на различни видове антисенс олигонуклеотиди с използване на различни молекулни механизми на РНК инхибиране



30.11.2022 г. 30.11.2025 г.

Проектът “Сравнителен анализ на ефективността на нови антибактериални агенти базирани на различни видове антисенс олигонуклеотиди с използване на различни молекулни механизми на РНК инхибиране ” представлява своеобразно продължение на дългогодишни проучвания в областта на синтитечната биология и разработването на нови антибактериални агенти, които да бъдат тествани и оптимизирани, чрез подходящи модификации или различни молекулни механизми. Основният фокус на нашия проект са добре познатите за екипа ни антисенс олигонуклеотиди, с които работим активно през последното десетилетие в лабораторията на проф. Пенчовски в Биологически Факултет на Софийски Университет “Св. Климент Охридски” като продължение на неговия опит от работата му с бактериални рибопревключватели в Йейлския университет, САЩ, съвместно с Роналд Брейкър (откривател на рибопревключвателите). Атисенс олигонуклеотидите са агенти, които се свързват специфично с молекулата, към която са насочени. Към настоящия момент съществуват три поколения антисенс олигонуклеотиди, като всяко едно от тях има своите характеристики, плюсове и ограничения. За целите на нашия проект, ще създадем дизайн на различни антисенс олигонуклеотиди, които да бъдат представители на отделни генерации, както и такива, които ще бъдат химерни. Ще ги приложим в бактериални клетки, с цел извършване на генетичен контрол чрез специфичното им свързването с бактериални рибопревключватели. Бактериалните рибопревключвателите са структурни РНК домени, най-често разположени в 5’-нетранслиращият се регион на информационни РНКи, които специфично разпознават и свързват метаболити. Към настоящия момент не са открити данни за наличие на рибопревключватели в човешкия геном, което превръща бактериалните рибопревключватели в потенциални подходящи мишени за разработване на антибактериални средства. Структурата на повечето рибопревключвателите е позната, а в международните биоинформатичните бази данни: GenBank (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/), Rfam (https://rfam.xfam.org/), включително и в създадената от нас база данни RSwitch (https://penchovsky.atwebpages.com/applications.php?page=58 ) са достъпни и последователностите при отделни видове и техни представители. В резултат, от специфичното свързване на антисенс олигонуклеотидите и рибопревключвателите, в настъпват конформационни промени, които дават възможност на информационните РНКи да регулират своето изразяване, без необходимостта от регулаторни белтъци. Това води до невъзможността жизненоважни метаболити за бактериите да бъдат синтезирани от клетките и/или транспортирани вътре в нея от външната среда, водещо до бактериостатичен или бактерициден ефект. Сравнението на отделните варианти антисенс олигонуклеотиди, ще ни позволи да направим анализ помежду им и в резултат да отговорим на редица отворени въпроси за научната общественост по отношение на дизайна на антисенс олигонуклеотидите – основният им нуклеотиден скелет, генерацията, към която спадат и възможните модификации на структурата им. Като отделна задача в рамките на проекта си поставяме за цел да разширим познанията ни по отношение на видовете клетъчно-проникващи пептиди и тяхното поведение, когато са натоварени с антисенс олигонуклеотиди, като проведем експерименти с избрани антисенс олигонуклеотиди и различни клетъчно-проникващите пептиди. В резултат от експериментите ще наблюдаваме влиянието върху ефективността на отделните комплекси от клетъчно проникващи пептиди и антисенс олигонуклеотиди. Ще съпоставим получените данни и ще дадем заключение за ефективността и приложимостта на всеки един от тях. Тази новополучена информация ще бъде от полза в по-нататъчните проучвания на колеги от цял свят. Чрез тези данни ще успеем да предложим класация за ефективността и от там да намалим неефективните опити за внос на антисенс олигонуклеотид в бактерия, времето за създаване на нови терапевтични агенти и разходите за експерименти и персонал. След като приключи нашият изключително успешен проект “Дизайн и експериментално валидиране на химерни антисенс олигонуклеотиди като антибактериални агенти”, резултатите от който са публикувани в 20 научни публикации с общ импакт фактор 84 точки (Q1-4 = 254 и 86 цитирания) и създадохме 16 софтуерни продукта, достъпни на официалния сайт на проф. Роберт Пенчовски (https://penchovsky.atwebpages.com/research.php), сме уверени, че със създаването на нови антисенс олигонуклеотиди, свързани с различни клетъчно проникващи пептиди, базирайки се на различни молекулни механизми на РНК инхибиране, с цел да сравним ефективността им, ще получим фундаментални данни, чрез които ще дадем нови посоки и ще начертаем нави хоризонти, ускорявайки процеса по създаване на антибактериални агенти срещу сериозни, живото застрашаващи патогенни бактерии.
АСО, антибиотици

Детайлна информация

Национален
Конкурс за финансиране на фундаментални научни изследвания – 2022 год. МОН - Фонд „Научни изследвания”
200000,00 0,00

Координатор


СУ"Св. Климент Охридски"

Роберт Димитров Пенчовски

Участващи подструктури на СУ "Св. Климент Охридски"


Ръководител(и) в СУ "Св. Климент Охридски"


Партньори на проекта



Научни прояви

<декември 2022 г.>
пнвтсрчтптсбнд
2829301234
567891011
12131415161718
19202122232425
2627282930311
2345678